Tras el éxito de la serie original de .Hack continúa esta nueva entrega del manga que ha sabido mezclar videojuegos realidad virtual y aventura a partes iguales. Año 2017. El cibermundo de The World en el que habitan los .hackers se ha convertido en un lugar peligroso. Haseo un jugador novato busca al misterioso Tri-Edge para salvar a Shino su antigua compañera de batallas. Tras enfrentarse a Endurance logra despertar a su avatar Skeith un nuevo poder con el que espera al fin derrotar al mal.